报告题目：基于异构系统的大规模质谱数据并行处理方法研究
报告人： 李闯
报告时间：2018年9月26日 下午2:30-3:30
报告地点：软件大楼302教室
报告人简介：李闯，湖南大学信息科学与工程学院2015级博士生。
导师： 李肯立教授。
主要研究兴趣为：并行计算、生物信息学。
报告主要内容：
近年来，随着质谱科学技术的迅速发展与普及，生物信息学数据特别是质谱数据的规模呈现出爆炸式增长，普通计算机的测序速度已经不能满足实际应用的需求，如何利用新的计算方式（例如GPU、MIC、FPGA等协处理器）来提高蛋白质测序的效率，成为了生物信息学大数据时代所关注的热点之一。
本次报告中介绍一种高效的、并行的肽段测序算法。该算法使用分布式计算框架开发出来，具有高效性以及高可扩展性。为使大规模质谱数据测序在异构众核系统中能够得到更加高效和稳定的并行处理，结合待分析质谱数据的结构及运行特征，需处理好异构众核系统中节点与节点之间、节点内部及核与核间的负载平衡、通信以及稳定运行等关键问题，本工作提出了动态数据和任务划分和通信优化策略。
