宋勃升
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教师介绍

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宋勃升,博士,副教授,博士生导师,岳麓学者,入选2项省级人才项目(湖湘青年英才、湖南省优青)。2015年博士毕业于华中科技大学。2016年3月至2019年2月在华中科技大学从事博士后研究工作。2019年2月,湖南大学人才引进入职信息科学与工程学院。获2019年ACMSIGBIO中国新星奖(当年2人入选),IMCS学会2020年度最佳论文奖(第一作者),获2022年湖南省计算机学会科学技术二等奖(排名第一),入选湖南大学优青培育计划和青年教师托举计划。目前研究方向为生物计算、计算智能,图神经网络等,近年来在国际期刊和国际会议上发表相关领域学术论文90多篇,其中以第一/通讯作者发表在IEEE-TCYB、IEEE-TPDS、IEEE-TC等高水平SCI论文40多篇(中科院一区/CCFA类/IEEE汇刊论文20篇,5篇影响因子大于10,5篇论文入选ESI高被引,另有3篇一作论文入选杂志“TopCitedArticle”)。担任IEEE-TNB、IEEE-TSMCS等40多个国际知名SCI期刊审稿人。每年担任BIC-TA,BICAS,HPCC等多个国际会议PCMember。主持国家级项目3项,省部级项目4项,参与国家级项目2项。
中文名: 宋勃升 英文名:
学历: 博士 职称: 副教授
联系电话: 电子邮件: boshengsong@hnu.edu.cn
研究方向: 生物计算,生物信息学,药物发现
联系地址: 湖南省长沙市岳麓区麓山南路2号,湖南大学信息科学与工程学院(410082)
所属机构:  计算机科学系  学院教师
学生培养

毕业学生:

        2022届:罗晓妍(德睿实习,长沙银行工作)

                       苏祥(南京数睿数据)

        2023届:程玉(英国爱丁堡大学读博,全球大学排名22位)

                       胡传龙(武汉大学读博)

                       李芬(华为)

                       李梓盟(阿里巴巴)

指导学生:

        2021级硕士:陈述高、王玉杰

        2022级硕士:程志祥、侯琳琳

        2023级硕士:何玉琴、李晓雯、张嘉仪、胡君爽

        2020级博士:李艳艳

        2023级博士:马腾飞        

招生计划

        本人招收2024年硕士研究生3名左右,研究方向为生物信息学,生物计算等。课题组长期招收博士及博士后,欢迎感兴趣的学生与我联系


科研状况

1. 国家自然科学基金面上项目,62272151,多通道膜系统及应用研究,2023/01-2026/12,在研,主持

2. 国家自然科学基金面上项目,61972138,动态结构膜系统及应用研究,2020/01-2023/12,在研,主持

3. 湖南省青年科技人才(荷尖人才)项目,2022RC1099,2022/09-2025/09,在研,主持

4. 湖南省优秀青年科学基金项目,2022JJ20016,生物计算模型理论及实现,2022/01-2024/12,在研,主持

5. 之江实验室开放课题2021RD0AB02新型类组织膜系统理论及实现方法研究2022/01-2023/12在研主持

6. 湖南省自然科学基金面上项目,2020JJ4215树状结构膜系统理论及应用研究2020/01-2021/12,已结题,主持

7. 长沙市重点研发计划项目,kq2004016,膜计算系统理论及应用研究2020/09-2022/08,已结题,主持

8. 国家自然科学基金青年基金项目,61602192,基于细胞间通讯的膜计算系统与算法研究,2017/01-2019/12,已结题,主持

9. 中国博士后科学基金面上一等资助,2016M600592,基于细胞生化机理的通讯膜计算系统研究,2016/11-2019/01,已结题,主持

10. 中国博士后科学基金特别资助,2017T100554,通讯膜计算系统及其在生物学中的应用,2017/06-2019/01,已结题,主持


学术论文

一、近3年主要代表性论文(第一/通讯作者)

1. Bosheng Song, Kenli Li, David Orellana-Martín, Xiangxiang Zeng*, Mario J. Pérez-Jiménez, Tissue P systems with states in cells, IEEE Transactions on Computers, 2023, 72(9), 2561-2570. (SCI,CCF A类)

2. Bosheng Song, Kenli Li*, Xiangxiang Zeng, Mario J. Pérez-Jiménez, Claudio Zandron, Monodirectional evolutional symport tissue P systems with channel states and cell division, SCIENCE CHINA Information Sciences, 2023, 66(3), 139104. (SCI,CCF A类)

3. Yanyan Li, Bosheng Song*, Xiangxiang Zeng, Rule synchronization for monodirectional tissue-like P systems with channel states, Information and Computation, 2022, 285, 104895. (SCI,CCF A类,理论计算机顶刊)

4. Bosheng Song, Kenli Li, Xiangxiang Zeng, Monodirectional evolutional symport tissue P systems with promoters and cell division, IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems2022, 33(2), 332-342. (SCI,CCF A类)

5. Bosheng Song, Xiaoyan Luo, Xiaoli Luo,Yuansheng Liu, Zhangming Niu, Xiangxiang Zeng*, Learning spatial structures of proteins improves protein–protein interaction prediction, Briefings in Bioinformatics2022, 23(2), bbab558.  (SCIIF=13.994, 中科院一区,ESI高被引论文,生物信息学顶刊)

6. Bosheng Song, Fen Li, Yuansheng Liu, Xiangxiang Zeng, Deep learning methods for biomedical named entity recognition: a survey and qualitative comparison, Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(6), bbab282. (SCI,IF=13.994, 中科院一区,生物信息学顶刊)

7. Yu Cheng, Yongshun Gong, Yuansheng Liu*, Bosheng Song*, Quan Zou, Molecular design in drug discovery: a comprehensive review of deep generativemodels, Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(6), bbab344. (SCIIF=13.994, 中科院一区,生物信息学顶刊)

8. Bosheng Song, Shengye Huang, Xiangxiang Zeng, The computational power of monodirectional tissue P systems with symportrules, Information and Computation, 2021, 281, 104751. (SCI,CCF A类,理论计算机顶刊)

9.  Bosheng Song, Kenli Li, David Orellana-Martín, Mario J. Pérez-Jiménez, Ignacio Pérez-Hurtado, A survey of nature-inspired computing: membrane computing, ACM Computing Surveys, 2021, 54(1), 1-31. (SCI,IF=14.324, 中科院一区顶刊)

10.  Bosheng Song, Linqiang Pan, Rule synchronization for tissue P systems, Information and Computation, 2021, 281, 104685. (SCI,CCF A类,理论计算机顶刊)

11. Bosheng Song, Xiangxiang Zeng, Alfonso Rodríguez-Patón, Monodirectional tissue P systems with channel states,  Information Sciences, 2021, 546, 206-219. (SCI,中科院一区顶刊)

12. Bosheng Song, Xiangxiang Zeng, Min Jiang, Mario J. Pérez-Jiménez, Monodirectional tissue P systems with promoters, IEEE Transactions on Cybernetics, 2021, 51(1), 438-450. (SCIIF=19.118, 中科院一区顶刊,ESI高被引论文)

13. Bosheng Song, Kenli Li, David Orellana-Martín, Luis Valencia-Cabrera, Mario J. Pérez-Jiménez, Cell-like P systems with evolutional symport/antiport rules and membrane creation, Information and Computation, 2020, 275, 104542. (SCI,CCF A类,理论计算机顶刊)

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