
学位论文简介
随着超级计算机向百万兆次级性能发展,科学计算规模不断扩大。自适应网格细化(Adaptive Mesh Refinement,AMR)技术通过减少冗余信息,成为大规模科学计算的关键工具;而有损压缩技术则能有效提升数据缩减比,广泛应用于高性能计算与数据管理领域。然而,当前主流有损压缩算法在针对AMR科学数据压缩时,仍面临压缩率不足与计算复杂度高的双重挑战,亟待开展深入优化。
针对上述问题,本研究围绕“基于AMR特征的有损压缩算法设计与性能优化”展开,从AMR应用优化和压缩器内在机制优化两个层面,系统提出了系列高效方法。本文主要创新成果如下:
1)提出基于AMR层级相关映射处理的LAMP算法,利用相邻层级数据相似性进行预处理,结合AMR特有的box网格结构设计层级映射表,显著提升数据压缩率,最大提升达63.8%。
2)针对三维AMR数据密度分布不均问题,设计基于数据密度划分的AMRDPC算法,提出快速k-d树回填策略与循环反转数据补丁策略,在保证误差可控的同时,将压缩率提升5.73倍,吞吐量提高18.83%。
3)针对压缩速度瓶颈,设计基于高效嵌入式编码的ZFP-X算法,以比特组替换位平面存储压缩数据,避免位平面构建与组测试开销,在保持压缩率不变的前提下,最高提升压缩吞吐量65.51%,并在多类科学数据中表现出显著加速优势。
本研究在AMR有损压缩算法领域取得了一系列具有理论价值与应用前景的成果,进一步推动了该方向的前沿发展。
主要学术成果
[1] Yida Li, Huizhang Luo, Fenfang Li, Junqi Wang, Kenli Li. LAMP: Improving Compression Ratio for AMR Applications via Level Associated Mapping-Based Preconditioning[J]. IEEE Transactions on Computers, 2023, 72(12): 3370--3382.(第一作者,CCF A类期刊)
[2] Yida Li, Huizhang Luo, Yufeng Zhang, Keqin Li, Kenli Li. An Efficient Lossy Compression Framework for Density Partitioning in AMR Applications[J]. The Journal of Supercomputing, 2025, 1--28.(第一作者,CCF C类期刊)
[3] Bing Lu, Yida Li, Junqi Wang, Huizhang Luo, Kenli Li. ZFP-X: Efficient Embedded Coding for Accelerating Lossy Floating Point Compression[C]. IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium, 2023, 1041--1050.(第二作者,CCF B类会议)
[4] Yida Li, Huizhang Luo, Chubo Liu, Kenli Li. Exploring Level-Wise Interpolation to Improve Lossy Compression Ratio for AMR Applications[C]. Advances in Natural Computation, Fuzzy Systems and Knowledge Discovery, 2022, 259--266.(第一作者,EI会议)
[5] 李肯立,黎毅达,罗辉章,阳王东,唐卓,刘楚波,刘刚。层级数据关系的获取方法、装置及其计算机设备(专利号:CN115220657A,已公开)